Mavesår kan kun diagnosticeres ved en grundig kikkertundersøgelse af hestens mave (gastroskopi), og mavesår behandling afhænger af hvor i maveslimhinden sårene sidder og hvor dybe de er.
Overfladisk rødme og irritation (grad 1) i mavenslimhinden er oftest ikke behandlingskrævende, og kan typisk hele fint ved at korrigere foderplanen. Dybe sår kræver derimod behandling.
Er sårene i maveslimhinden dybe vil en behandling med mavesårsmedicin (Omeprazol) være nødvendig. Dosis af mavesårsmedicin og behandlingens varig afhænger af hvor sårene er lokaliseret.